儿童性发育异常遗传检测与咨询专家共识(2025)
一、疾病概述
DSD是由欧洲儿科内分泌协会和美国劳森威尔金斯儿科内分泌协会在2006年美国芝加哥的国际会议发布的专家共识中首次确切提出并统一命名的[4],已被医学界广泛接受和应用。DSD患病率约1:5000[5],按照性染色体核型分为性染色体异常DSD、46、XY DSD及46、XX DSD,分别占比10%~15%、75%和10%~15%[6-7]。按照临床表型可分为非综合征型DSD和综合征型DSD[8],后者指除性腺系统异常外,同时存在其他系统异常。
二、致病机制与遗传学诊断基础
DSD致病机制复杂。46,XX DSD主要为先天卵巢分化异常和先天性肾上腺皮质增生症等;46,XY DSD遗传背景最为复杂,可归纳为(1)性腺分化发育异常(完全或部分型性腺发育不良如Swyer综合征、卵睾型DSD及睾丸退化等);(2)雄激素合成或功能障碍(睾酮合成障碍,如促黄体生成素受体变异、类固醇合成急性调节蛋白缺陷症、17α-羟化酶缺陷症、5α-还原酶缺陷症等,雄激素作用障碍,如雄激素不敏感综合征及药物或环境因素等其他原因所致[9,90];(19,900);基因变异成等为常见,国内报道46,XY DSD单基因变异的检出率为45%~60%,其中,SRD5A2、AR、NR5A1是常见的致病基因[1,3,11]。另外,印记基因异常[8]、染色体拷贝数变异(copy number variations,CNV)[12]、非编码区变异和寡基因遗传等均有报道[13-19];(3)尚有约半数病因及机制不明者。
三、遗传学检测指征和检测流程
(一)检测指征
推荐对所有DSD患儿行遗传学检测。DSD的传统诊断策略是从临床表型和核型分析进行判断,但是内分泌激素检测和影像学评估不能区别不同病因所致的重叠的临床表型。儿童期下丘脑-垂体-性腺轴存在较长时间的静默期,前期研究许多DSD患儿经过多次的内分泌激素检测、影像学检查和诊断性手术后,依然未获得病因诊断。DSD转化研究网络的数据显示,在未获得病因诊断的患者中,97%没有进行遗传学检测[20]。精准病因诊断是进行最佳临床实践的基石。我国遗传学检测相对可及性高,建议对于所有DSD患者,优化诊断策略,尽早行遗传学检测以便获得精准诊断,减少不必要的激发实验等多次激素检测取血对患儿带来的伤害。
(二)检测前遗传咨询
检测前遗传咨询是基因检测不可或缺的重要环节之一,是保障遗传检测被合理利用、达到患者获益最大化、负面影响最小化的重要措施,也是了解患者家族史、指导患者及其家庭成员的重要环节,必须足够重视。故临床医师首先应全面采集信息,询问家族史并绘制家系图;明确遗传学检测需求和目的;向患儿家长详细介绍遗传学检测对DSD诊治的获益、风险和局限性;告知预期检测结果、次要和意外发现的知晓权;可能后续需要补充其他检测项目或对数据重分析等;建议遗传检测能够同时送检父母样本。
(三)检测方法
不同检测方法可检测范围以及检测时间详见表1,包括染色体核型分析、荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization, FISH)、染色体微阵列分析(chromosomal microarray analysis, CMA)、一代测序(Sanger测序)、实时荧光定量PCR、多重连接探针依赖的扩增技术(multiplex ligation-dependent probe amplification technology, MLPA)、二代测序[包括全基因组测序(whole genome sequencing, WGS)、全外显子组测序(whole exome sequencing, WES)、基因 panel测序)、CNV测序(CNV-Seq)等]、长读长测序(有时也称三代测序)等。
(四)遗传学检测流程
遗传学检测流程见图1。
1. 基础检测步骤:推荐所有患儿首先进行染色体核型分析以检测性染色体异常导致的DSD,必要时完善FISH、CNV测序、CMA以检测性染色体异常嵌合、拷贝数变异、染色体微缺失和重复等异常。
2. 诊断46, XX DSD者,以不同类型的先天性肾上腺皮质增生症等雄激素合成过多的疾病为主,最常见的先天性肾上腺皮质增生症类型为21羟化酶缺陷症(21-hydroxylase deficiency, 21-OHD),其致病基因CYP21A2存在假基因干扰,不适宜采用二代测序,建议采用特异长片段PCR加一代测序或二代测序加MLPA或长读长测序检测CYP21A2基因变异。除外21-OHD后,可采用二代测序检测46,XX DSD患者以获得更快的检测速度、更好的检测效率和更高的阳性率。
3. 诊断46, XY DSD者,以单基因变异为主,建议首选 panel 测序作为一线检测方法,以减少目标基因外冗余数据对于分析的干扰,但由于遗传异质性,其应用也易漏诊。WES可以减少这种漏诊且
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|检测技术|时效性|检测 用时(d)|报告 用时(d)|检测范围|适用变异类型| |---|---|---|---|---|---| |核型分析|慢|7~15|15~21|全染色体|>10 Mb染色体倒位或易位或缺失或重复等结构变异情况和染色体形态异常| |FISH|较快|2~3|3~7|染色体片段|已知CNV、嵌合体、分裂中期FISH可检测结构变异| |MLPA或MS-MLPA|较快|2~3|3~7|基因片段|MLPA可检测已知基因缺失或重复、MS-MLPA可以检测甲基化异常或单亲二倍体或缺失和重复| |Q-PCR测序|快|1|3|基因片段|基因拷贝数变异(缺失或重复)| |CMA|较快|2~4|7~14|全染色体|>1 Mb的CNV、>5 Mb的纯合区间、单亲二倍体、>10%嵌合体| |CNV测序|较快|2~4|7~14|全染色体|>1 Mb的CNV变异,>10%嵌合体| |Sanger测序|快|1|3|目标基因序列|目标基因SNV、Indels| |Panel测序|较快|2~14|14~28|目标基因外显子|SNV、部分外显子Indels、CNV| |特异长片段PCR测序|较快|14|14~28|目标基因序列|含有同源系列(假基因)的基因(如:CYP21A2)| |WES|较快|2~7|7~20|全外显子序列|全部基因外显子SNV、Indels、外显子缺失重复、CNV| |WGS|快|1~5|2~20|全基因组序列|几乎全部基因组序列(98%)、外显子及内含子SNV、Indels、CNV、结构变异、纯合区间、动态变异| |长读长测序|一般|7~14|10~30|目标基因序列|重复序列或假基因区域SNV、Indels、结构变异|
注:FISH为荧光原位杂交;MLPA多重连接依赖式探针扩增;MS-MLPA为甲基化特异性MLPA;Q-PCR为实时荧光定量PCR;CMA为染色体微阵列分析;CNV为拷贝数变异;WES为全外显子组测序;WGS为全基因组测序;SNV为单核苷酸变异;Indels为<50 bp的缺失重复;检测用时与报告用时与检测仪器种类及检测机构有关
![graph TD\n A1[性发育异常] --> A2[性染色体异常]\n A1 --> A3[46,XY]\n A1 --> A4[46,XX]\n A3 --> A5[特殊面容、骨骼发育异常、ID、合并其他系统异常等]\n A4 --> A6[CAH?]\n A5 --> A7[可识别的单基因遗传病或综合征]\n A5 --> A8[非可识别的单基因遗传病或综合征]\n A5 --> A9[可识别的印记基因异常,如PWS]\n A6 -->|是| A10[需联合long-PCR、MLPA或三代测序]\n A6 -->|否| A11[WES或家系WES]\n A7 --> A12[Panel或WES或家系WES+CNV测序]\n A8 --> A13[WES或家系WES+CNV测序]\n A9 --> A14[甲基化分析MLPA]\n A10 -->|阴性| A11\n A10 -->|阴性| A14\n A11 -->|阴性| A14\n A12 -->|阴性| A15[WGS(可检测WES、CMA等检测不出的如深度内含子区变异、结构变异等)]\n A13 -->|阴性| A15\n A14 -->|阴性| A15\n](1/parseimages/figure96c7b096165f4fa6ac90dab50c31cd98_0_5.png) 注:ID为智力发育落后;CAH为先天性肾上腺皮质增生症;PWS为Prader-Willi综合征;Panel为靶向基因测序;WES为全外显子组测序;CNV为拷贝数变异;MLPA多重连接依赖式探针扩增;long-PCR为特异长片段PCR测序;WGS为全基因组测序;CMA为染色体微阵列分析
除已知致病基因还可以发现潜在新致病基因,经济许可且与家长沟通获得同意后可首选。WES和CNV测序阴性者可进行WGS明确是否存在深度内含子、复杂结构变异及调控区变异等。
4. 考虑综合征型DSD者,推荐WES为基础联
合 CNV 测序的序贯法。
5. 其他检测:涉及印记基因变异的疾病如Prader-Willi综合征优先选择印记区甲基化MLPA进行检测。另外,随着测序技术的进步和成本的降低,家系WES和WGS也越来越多被应用于性发育异常的辅助诊断。家系WES可过滤掉大量从父母遗传而来但无害的常见变异,快速聚焦在患者独有的或符合特定遗传模式的少数可疑变异上,提高分析效率和准确性;WGS可以有效检出WES无法检出的深度内含子变异[21]、复杂结构变异[22]、调控区变异等[23-24],且对于CNV、插入缺失、结构变异等分辨率更高,更精准。当临床表征、家族史和分子遗传学发现之间存在“不匹配”或“不完全”时,就是需要考虑寡基因或其他复杂遗传模式。
6. 检测局限性:并无100%的单一方法可一次性对DSD所有病因作出诊断[6]。需要结合具体疾病及不同基因特点设计有针对性的全面检测方案。通常检测标本为外周血,若情况允许,可获取性腺等特殊组织标本进一步行遗传学检
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测,以提高阳性率。
四、基因检测报告出具及检测结果咨询
基因检测机构不能代替临床医师对受检者作出临床诊断,而是应将检测结果客观列出并进行说明。DSD基因检测报告出具建议参照2018年国内制订的关于临床基因检测报告的规范和共识[25],且建议患者进行临床遗传咨询。针对检测结果进行详细解释,针对包括如何治疗、长期检测的内容和青春期发育、婚育预期等预后信息对家长进行讲解,必要时多学科会诊。
1. 致病性和可能致病性变异:DSD精准诊断有助于指导临床决策,包括性别分配、治疗方案制订、生育能力的预估、预测肿瘤的发病风险以及提供相应的遗传咨询,为优生优育提供依据。只有基因检测结果与临床表型和激素特点相互印证才能确诊。若临床表型、激素结果高度怀疑,但基因结果不符合,建议对基因检测结果重新分析,或综合考虑是否需要再补充其他方法的基因检测。DSD管理中性别分配极为复杂。研究趋向于对病因明确者以病因诊断和心理性别作为主要分配依据[26-32],比如5α-还原酶缺陷症、NR5A1基因变异DSD以男性性别占优势倾向于按男孩抚养,完全性雄激素不敏感综合征的推荐抚养性别是女性,部分性雄激素不敏感综合征患儿呈不同程度的男性化倾向,尚无抚养性别推荐方案,大多选择按男孩抚养。确诊21-OHD需要早期给予肾上腺皮质激素替代治疗并长期监测优化用药剂量。
2. 意义未明的变异(variants of uncertain significant, VUS):当变异的致病性评级为VUS时,需谨慎解读[33]。应再次补充临床和实验室证据,重新进行致病性评级以确认致病性,避免误诊、漏诊。同时向患儿及其家庭告知随时间推移和医学认识的逐渐进步,意义不明的变异可能会被重新分类为致病性或良性变异[33]。无法确定致病性的,不能排除临床诊断,必要时加做功能试验。
3. 基因检测阴性可能原因:(1)尚未被认识的致病基因;(2)低比例嵌合体如体细胞嵌合体和(或)生殖细胞嵌合体等现代的常用技术无法分辨;(3)测序技术局限性导致的假阴性,如包括基因特殊结构变异、高度同源的假基因、捕获-测序技术不能保证覆盖100%的外显子区域等;(4)样本质量及样本错误导致的测序质量不合格或测序结果不准确;(5)其他原因如解读流程遗漏等;(6)遗传学认识的局限性。基因检测阴性的患儿建议随访,必要
时复测或重新分析,以获取新的证据明确病因。
五、再生育指导和遗传风险评估原则
明确遗传学检测结果仅协助风险度预测而不可能100%避免再发遗传性疾病。准备再生育的家庭宜在有资质开展产前诊断的机构进行产前遗传咨询和再生育风险评估。
40%~60%的DSD遵循单基因遗传,遗传方式包括X连锁隐性遗传、X染色体显性遗传、Y染色体遗传、常染色体隐性和常染色体显性遗传,也有寡基因遗传的报道,部分基因可有多种遗传方式。但是尚有约50%是寡基因或多基因遗传方式。其中,涉及性别再分配,需要区分被再分配后男女的患病风险,比如,5α-还原酶缺陷症影响的是男性性别发育,通常在46,XY个体中才有相应的临床表现,而46,XX的女性即使携带复合杂合变异通常也没有临床症状。另外,多数DSD疾病涉及生育问题,在做遗传咨询时需要结合先证者所患疾病的生育力情况再讨论后代的患病风险。随着辅助生殖技术进步,患者的生育问题将会越来越多地得到改善,故推荐对此类患者尽早行生育力评估,在遵循知情同意、自愿、保密、伦理监督及非商业化的原则情况下,鼓励进行生育力保存。
六、产前诊断
先证者基因诊断不明者,无法进行遗传学产前诊断。若先证者致病基因已经明确,无论缺陷基因是否遗传于父母,患儿家庭计划再次生育时,建议(1)若自然受孕行产前诊断;(2)若辅助生殖植入前进行遗传学检测(preimplantation genetic testing, PGT)。产前诊断根据母亲孕周选取不同的取材方法,包括孕11~13周绒毛活检和孕17~24周行羊膜腔穿刺术[34]。但是,产前即使能诊断,因DSD的临床表现差异大,大多数疾病不影响生命,一旦发现阳性结果,是否终止妊娠需要具体讨论。
在实施 PGT 前夫妻需要接受详细的遗传咨询和知情同意,充分了解自身的生育和遗传风险,以及 PGT 技术存在的局限性,在充分知情后,自愿选择是否采用 PGT 技术。
DSD是一组遗传异质性疾病,遗传学诊断有助于早期合理的性别判定,可以提供疾病预后以及家庭内再发风险的信息,对于科学管理DSD至关重要。随着分子生物学技术的发展以及基因谱和表型谱的不断扩充,基因检测在DSD诊断中将发挥更大的作用,预期可进一步提高DSD病因诊断率。未来可开展多中心注册研究,在全国范围内建立数据
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互通和信息共享的DSD遗传资源数据库,收集中国人群DSS患者的基因型,表型谱,进一步明确中国患儿遗传学特点,为精准诊疗和优生优育提供参考。
(李乐乐 李晓侨 巩纯秀 执笔)
参与本共识制订的专家名单(按单位和姓名拼音排序):成都市妇女儿童中心医院(程昕然);重庆医科大学附属儿童医院(朱岷);大连市妇女儿童医疗中心(常波);复旦大学附属儿科医院(罗飞宏);福建省妇幼保健院(郭敬民);福建省福州儿童医院(陈端敏);广西医科大学第二附属医院(范歆);广州医科大学附属妇女儿童医疗中心(张文);国家儿童健康与疾病临床医学研究中心;浙江大学医学院附属儿童医院(傅君芬);国家儿童医学中心首都医科大学附属北京儿童医院(巩纯秀、李乐乐、李俊骅);河南省儿童医院(卫海燕);华中科技大学同济医学院附属同济医院(罗小平);吉林大学第一医院(杜红伟);江西省儿童医院(杨玉);昆明市儿童医院(陶娜);山东省立医院(李桂梅、孙妍);山西省儿童医院(宋文惠、张改秀);上海交通大学附属儿童医院(李嫔);上海交通大学附属瑞金医院(董治亚);上海交通大学附属上海儿童医学中心(王秀敏);深圳市儿童医院(苏喆);首都医科大学附属首都儿童医学中心(曹冰燕、陈晓波);苏州大学附属儿童医院(陈临琪、陈婷);天津医科大学总医院(郑荣秀);武汉儿童医院(姚辉);西安交通大学第二附属医院(肖延风);西安市儿童医院(汪治华);中国医科大学附属盛京医院(辛颖);中山大学附属第一医院(李燕虹、马华梅)
利益冲突 所有作者声明无利益冲突
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·作者须知·
中华医学会系列杂志论文作者署名规范
为尊重作者的署名权,弘扬科学道德和学术诚信精神,中华医学会系列杂志论文作者署名应遵守以下规范。
一、作者署名
中华医学会系列杂志论文作者姓名在题名下按序排列,排序应在投稿前由全体作者共同讨论确定,投稿后不应再作改动,确需改动时必须出示单位证明以及所有作者亲笔签名的署名无异议的书面证明。
作者应同时具备以下4项条件:(1)参与论文选题和设计,或参与资料的分析与解释;(2)起草或修改论文中关键性理论或其他主要内容;(3)能对编辑部的修改意见进行核修,对学术问题进行答辩,并最终同意该文发表;(4)除了负责本人的研究贡献外,同意对研究工作各方面的诚信问题负责。仅参与获得资金或收集资料者不能列为作者,仅对科研小组进行一般管理也不宜列为作者。
二、通信作者
每篇论文均需确定一位能对该论文全面负责的通信作者。通信作者应在投稿时确定,如在来稿中未特殊标明,则视第一作者为通信作者。集体署名的文章应将对该文负责的关键人物列为通信作者。无论包含几位作者,均需标注通信作者,并注明其Email地址。
三、同等贡献作者
不建议著录同等贡献作者,需确定论文的主要责任者。
确需著录时可在作者项后另起一行著录“××和××对本文同等贡献”,英文为“×× and ×× contributed equally to the article”。
同一单位同一科室作者不宜著录同等贡献。作者申请著录同等贡献时需提供全部作者的贡献声明,期刊编辑委员会进行核查,作者贡献声明须刊登在论文结尾处。
四、志谢
对给予实质性帮助而又不能列为作者的单位或个人应在文后给予志谢。但必须征得志谢人的书面同意。被志谢者包括:(1)对研究提供资助的单位和个人、合作单位;(2)协助完成研究工作和提供便利条件的组织和个人;(3)协助诊断和提出重要建议的人;(4)给予转载和引用权的资料、图片、文献、研究思想和设想的所有者;(5)作出贡献又不能成为作者的人,如提供技术帮助和给予财力、物力支持的人,此时应阐明其支援的性质;(6)其他。不宜将应被志谢人放在作者的位置上,混淆了作者和被志谢者的权利和义务。
本刊编辑部
| 检测技术 | 时效性 | 检测 用时(d) | 报告 用时(d) | 检测范围 | 适用变异类型 |
|---|---|---|---|---|---|
| 核型分析 | 慢 | 7~15 | 15~21 | 全染色体 | >10 Mb染色体倒位或易位或缺失或重复等结构变异情况和染色体形态异常 |
| FISH | 较快 | 2~3 | 3~7 | 染色体片段 | 已知CNV、嵌合体、分裂中期FISH可检测结构变异 |
| MLPA或MS-MLPA | 较快 | 2~3 | 3~7 | 基因片段 | MLPA可检测已知基因缺失或重复、MS-MLPA可以检测甲基化异常或单亲二倍体或缺失和重复 |
| Q-PCR测序 | 快 | 1 | 3 | 基因片段 | 基因拷贝数变异(缺失或重复) |
| CMA | 较快 | 2~4 | 7~14 | 全染色体 | >1 Mb的CNV、>5 Mb的纯合区间、单亲二倍体、>10%嵌合体 |
| CNV测序 | 较快 | 2~4 | 7~14 | 全染色体 | >1 Mb的CNV变异,>10%嵌合体 |
| Sanger测序 | 快 | 1 | 3 | 目标基因序列 | 目标基因SNV、Indels |
| Panel测序 | 较快 | 2~14 | 14~28 | 目标基因外显子 | SNV、部分外显子Indels、CNV |
| 特异长片段PCR测序 | 较快 | 14 | 14~28 | 目标基因序列 | 含有同源系列(假基因)的基因(如:CYP21A2) |
| WES | 较快 | 2~7 | 7~20 | 全外显子序列 | 全部基因外显子SNV、Indels、外显子缺失重复、CNV |
| WGS | 快 | 1~5 | 2~20 | 全基因组序列 | 几乎全部基因组序列(98%)、外显子及内含子SNV、Indels、CNV、结构变异、纯合区间、动态变异 |
| 长读长测序 | 一般 | 7~14 | 10~30 | 目标基因序列 | 重复序列或假基因区域SNV、Indels、结构变异 |
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引用 / 出处
中华医学会儿科学分会内分泌遗传代谢学组. 儿童性发育异常遗传检测与咨询专家共识(2025)[J]. 中华儿科杂志, 2025.